虽然被断了水源，但打箭炉城堡的水窖之水仍能供十日之需，毕竟城堡之中，守军和康定衙门官员、下人仆役总共不过三百人。曲珍下令实行饮水配给制，又派了心腹守卫水窖，这样的措施虽然合理，却让城堡之中的恐慌情绪日盛。有个衙门官员本就是被裹胁，如今见败局已定，便暗中与守军头目串连试图投降，却不料守军头目转身就告诉了曲珍。曲珍十分恼怒，当即将这官员和家属吊死在城堡大门口，以此来警告有异心之人，同时也告诉霹雳军其死战到底的决心。
李爽和顿珠也知道这事急不得，便严令守好下山的路和山顶的泉眼，防止叛军的困兽犹斗，又让民兵们返家。围困打箭炉城堡，凭两个营的霹雳军已是绰绰有余，何况还有康定轻型团的助战，兵力接近两千人，是守军的十倍，已是猛虎扑兔之势。不出霹雳军所料，曲珍不甘心坐以待毙，不断派人出堡夜袭。在地雷和弹雨之下，出堡的敌人被打得死伤惨重。随着一次次的失败和饮用水越来越少，叛军士气变得越发低落。半个月之后，叛军停止了夜袭，他们无精打采地站在堡墙上，个个面色黑黄、嘴唇干枯、眼神空洞。
一个月后，城堡中的水窖干涸了。没有粮食，人还可以硬抗一段时间，没有水却连三日也难以支撑。城堡之中有金银丝绸，还有大量的青稞、小麦甚至稻米和蔗糖，却无人对这些东西感兴趣。曲珍仍然不肯投降，她甚至起了一把火烧掉城堡的念头，自己得不到的东西，别人也休想得到。只不过她明白，这个命令不会得到执行，自己投降不会有好结果，但大部分手下却有活命的机会——霹雳军整日喊着“投降不杀”劝降口号，他们还试图用城堡来换取从轻发落。眼下城堡中还有接近二百人，他们之中绝大部分不愿意与城堡一起化为灰烬。
曲珍服毒自尽了。她明白即便不自杀，也会有人拿自己的脑袋作投名状。在临死之前，她哀求守军头目将年幼的丹增交到山下霹雳军的指挥官手中——她并不知道李爽已到康定。曲珍痛恨霹雳军，但也知道霹雳军不会为难一个幼儿，更何况丹增还是泽郎的亲骨肉，至少会性命无虞。相较于丹增的亲哥哥阿旺，她更相信霹雳军。阿旺或许不会加害自己同父异母的弟弟，但他的身边人为了永绝后患，难免不会对丹增下黑手。作为交换，曲珍在服毒之前告诉让守军头目，他可以等自己气绝后，割下头颅前去投降。
打箭炉城堡的投降，标志着康定之乱的平定，接下来便是善后事宜。在临行前，欧阳轩曾与李爽作过一番长谈。按照欧阳轩的想法，军事行动结束之后，应在康定建立一套行之有效的管理制度。这既是因为康定对于霹雳军极为重要，也是因为欧阳轩要以此为契机，探索出夷蕃地区乃至治下边远地区的治理制度，核心原则是既管长远，成本也要低，仅需中枢投入少量资源或不投入资源。话说这可是个棘手活儿，毕竟这些地方山高水险，自古以来内斗攻伐不止，中原王朝靠着恩威并施的手段，维持着各部族表面的臣服。要对原有的羁縻政策作出大改动，阻力不是一般的大。
李爽在广泛征求山寨头人和草原部落首领意见的基础之上，制定出了霹雳军对康定治理的新方案，并通过快马接力和飞鸽传书的方式传回了总部。在等待回复的时间内，他开始对叛乱事宜进行了清算。鉴于曲珍已死，对其罪行不再追究，丹增则由人送往遥远的松州草原，那里的气侯环境与康定相似。这样做既是保护丹增人身安全，也是为了防止有人利用他再次在康定发动叛乱。追随曲珍叛乱的人员，则按照其罪行轻重，分别发配到养马场、矿洞服苦役，或就地从事修路架桥的劳役。
阿旺对康定轻型团的表现颇为不满，认为他们未尽职责以致其父被毒杀，康定也差点变天。李爽采纳了他的部分意见，撤销了轻型团的番号，又命人进行了整编，将之编为一个独立营，下辖六个轻步连、三个轻骑连及一个营部连。独立营平日由霹雳军训练，战事由霹雳军指挥，其军官皆由平叛过程中表现优秀者擢升，在叛乱中的蛇鼠两端者则进行责罚、罢免和清退。除此之外，李爽还仿照霹雳军在独立营建立了政治指导员制度，由霹雳军选派人员担任。如果军官发动叛乱、逃跑、贪赃枉法等事宜，政治指导员可以阻止甚至采取断然措施。
仁泽部落被折分成了十几个小部落，话说这些小部落原本就是被仁泽通过各种手段兼并的。这些部落的头人也全部换成了亲霹雳军人员，并将其未成年子女送到康定，成为阿旺在孔子学院的同学，既有做质子之意，也是为了增进与阿旺的感情。为了防止仁泽从逻些潜回来重新发动叛乱，李爽下令除了繁殖和生产所必需的马匹之外，将这些部落多余的马匹全部征调到川西，以抵作战争赔偿。一方面霹雳军与元军大战，需要大量的马匹；另一方面也是为了削弱其战争潜力，即便仁泽能说服旧部发动叛乱，他们也会发现无马可用。当然，对于这些部落李爽并不是竭泽而渔。他派出使者晓谕草原各部，承诺以优惠价格提供粮食和生活必需品。李爽还宣布仁泽旧部受霹雳军保护，又派了康定独立营的轻骑驻扎在草原，清剿无法无天的马贼。
一个多月后，李爽接到了总部的回信——欧阳轩告诉他，霹雳军高层同意了他对康定治理的制度设计。按照该项制度，将以康定和原仁泽部落的辖区为基础，成立自治司衙门——简称康定土司衙门，治所设在打箭炉城堡，负责本辖区税收、开矿商事、民事治安等一切事务的管理——军事和教育除外。军事职责由驻扎在黎州的霹雳军山地团负责——康定独立营也由其指挥；教育则由康定孔子学院负责，经费由霹雳军府库支出，骨干师资从川西派来。由于全面推动教育的条件尚不成熟，霹雳军高层决定先选派天资聪慧的儿童和部落山寨头人的子弟，先行入读孔子学院。
首任康定土司由阿旺担任。该职位并不是世袭，而是十年一届。十年届满，如通过议会信任性投票可以连选连任，没有届数限制。议会成员由各山寨、各部落根据一定的比例推选产生，也是十年一届。如果土司去世，或身体条件不能胜任，则由康定地方议会推出三至五名侯选人，交由霹雳军议会推选出最终人选，经霹雳军总统签署命令后，方能成为新一届土司。话说此方案在霹雳军激进派看来太保守，蕃区治理政治大于经济，应派官员直接管理。在阿旺的支持者眼中，康定本应是其私产，却不以允许父死子继代代相传，实在不妥。欧阳轩并没有理会这些异议，在他看来不能为了稳定而保守，也不能因为改革而激进，李爽的方案是符合实际的折中方案。在信中，欧阳轩还告诉李爽，下一步将会在夷蕃等其他羁縻地区逐步推广土司制度。