公元2499年秋，一颗陨石冲向了地球，在进入大气层的几秒钟后，迅速燃烧分裂成无数碎片洒向大地，同时在分裂的瞬间释放出未知的气体，几分钟后，天空降下了“污浊”的雨水。
一开始，人们并没有将“雨水”放在心上，但随着淋雨的人们相继生病进入医院，人们才意识到“雨水”有问题，然而这份后知后觉却为时已晚。
仅仅半天的时间，淋雨的人们身体就发生了不同程度的变异，同时伴随着的还有理智的丧失，仿佛成为了传说中的丧尸一般，强大而危险。
当下就有专家对其进行了研究，在他们体内发现了一种病毒，危害性大且传染性极强，于是所有“患者”都被紧急隔离。
就在专家研究治疗药剂的时候，那些被雨水浸泡过的地方，随着水渍退去，却呈现出诡异的红色。紧接着，没有淋雨的人们也逐渐出现了异样：身体长斑，性情冲动易怒且具有攻击性。专家们开始意识到，这片地区的土地已经不干净了，病毒随着“雨水”降落在了这座城，不论是否淋雨，这座城的人们都正在被感染着。
一直以来安逸富足的生活，降低了人们对于危机的警惕，使得这场感染危机得以迅速扩展开来，毕竟谁能想到，有一天，“雨水”也会是带来危险的东西。
在人们意识到危机并开始行动时，事态已经有些失去了控制，感染人数持续上升，各种防控手段都已不再起作用。为了避免感染进一步地向外扩散，联合组织上层紧急决定，彻底放弃R城，动用核武器将之夷为平地……这是人类历史上最黑暗的一天，无数生命因为这一看似武断的决定而命丧于此。
然而，事态的严重程度仍旧超乎想象。
一颗核武虽然夷平了这片被感染的区域，同时又消灭了绝大多数的“感染者”，但是有些变异完全的强大“变异种”，却仍旧活了下来，他们甚至因为充斥四周的核辐射而变得更加强大，不断向外继续扩散。
随着这一消息的泄露，一时间，人们出现了大规模的恐慌，连核武都无法消灭，难道人类世界的末日就要到来了吗？
为了阻止感染扩散同时消除民众恐慌，联合军队立刻筑起厚重的围墙将R城包围，出动大量武力对“变异种”进行阻拦，同时还有专业人员穿戴防毒装备24小时不间断的进行消杀守护，相邻的c城和h城民众也被下令迁移到更远的城市。
一开始，人们似乎遏制住了感染扩散，就在民众逐渐从恐慌中走出的时候，相隔较远的m城却突然发现了“感染者”。
就在专家困惑感染来源的时候，周边又陆续有好几座城市出现了“感染者”。
一时间，人心惶惶。
在专家还没有研究出治疗药剂前，各地都在做两手准备：一方面加紧赶制防毒装备，但是民众实在太多了，供不应求；另一方面尽力阻隔感染扩散，但是在不明感染来源的情况下，阻隔行动收效甚微。
在几十座城市都莫名出现“感染者”之后，事态终于彻底失去了控制，感染数目每天都在以指数级增长，同时感染者也从人类扩散到了其它生物，一时间，人类四面楚歌。
幸存的人们被迫迁移至遥远的Z城，筑起了第一座“末世防御”，人类从此进入了真正的“末世危机”。