欧阳轩并没有南下指挥嘉定战役。他留在崇庆府一方面是为了统筹整个战局，毕竟密者火里当下兵临灌口寨城下，威茂和雅州方向也可能陡生变局，需要坐镇指挥。另一方面则是因为当前许多新技术研发正在关键时刻，需要他的指导和协调。他最上心的新型火药虽然已经研制成功，但离下一步的工业化生产尚有时日，除了制造设备跟不上的原因外，也缺乏许多关键原料，需要寻找替代材料。显微镜、青霉素、牛痘接种也取得了长足的进步，这些技术一旦应用，将会在降低死亡率方面有着重大意义。
南下嘉定的战役由参谋长黄大根指挥，乐全安和曹二狗率部分别从水陆两路进发。他们将先合攻眉州，再南下与支援嘉定守军。如果把嘉定城是比作铁砧的话，霹雳军便是挥向纽璘部蒙军的大锤。按照欧阳轩的要求，即便不能全歼蒙军，也将其打痛，尤其不能放过刘大耳、曹知州这两个卖国贼。这两人公然降蒙之后，四川战场上又有不少宋军将校也效仿恶行，献了城池和堡寨降蒙，所幸规模都不大，影响也不如两人这般恶劣。
从水路出发是是水军旅大部分兵力，乐全安只留了半个营的正规水军防守金马河沿线。这半个营看似少，但有沿线数个基干水上民兵营的支持，要防止蒙军渡河并无问题。改组后的水军旅有三个主力营和一个旅部营，主力营下辖一个重炮船连、二个轻炮船连和二个护卫船连，共装备有重炮船三艘，轻炮船十艘和护卫船二十艘。此次乐全安共带了三个重炮连、四个轻炮连和五个护卫船连，共计装备有重炮七十二门，速射炮八十门和数十门各型轻型小炮，另有若干爆破船、侦察船及大量的辎重运输船随行，计有大小船只三百余艘，士兵一千三百余人，民兵一千余人。
从陆路进发的野战师齐装满员有四千五百人，加上随行的五千余名民兵，人数超过了一万人。这些部队分为前中后三队，最前面的是一千五百人的骑兵旅。缴获加上从蕃区购入的大量战马，让骑兵旅达到了一人两马，战马数量已达三千多匹，机动性已经不输蒙古骑兵。只不过眼下霹雳军骑兵仍属于骑马步兵的范畴，他们到达眉州之后，除了向四方派出侦骑之外，立即开始构筑了防御工事，并在通往嘉定的官道上埋设了地雷，以防蒙古骑兵突然袭击。事实上，蒙古骑兵眉州地界只有少数侦骑，故地雷取得的战果极为有限。
在骑兵之后的则是两个步兵旅的二个轻步营和二个重步营，共计二千人。野战师的一个步兵旅下辖二个轻步营和一个重步营，两者都下辖五个连人数也相同，也都装备了长矛、巨盾、火枪、手雷等标配武器。他们之间区别在于装备了不同的野战炮，重炮营装备了四十五门重型野战炮，而轻炮营装备的则是九十门轻型野战炮。这些野战炮都在炮架上安装了轮子并由骡马拖拽，完全能跟上步兵的前进。
行军队列的最后面自然是基干民兵组成的后勤辎重队伍。霹雳军实行耕战一体，这些基干民兵皆是正值壮年的百姓，平日也训练不辍，此次随军出征带的武器虽然以冷兵器居多，但作战能力其实不输人数相当的新附军。打仗就是打的后勤，特别是对以火器为主战武器的霹雳军来说，保护后勤辎重更为重要，容不得半点损失。本着“小心驶得万年船”，曹二狗为此专门调了二个轻步营保护后勤辎重。眉州、嘉定地形多为丘陵低山，彭山前往两地的官道，也都是穿行在丘陵之间的山沟或为小盆地内。为了防止蒙古骑兵的突袭，曹二狗除了派大量的侦察骑兵前出外，又命轻装步兵沿官道两侧山道前进，以掩护大部队的两翼。
周见深的诈降让刘大耳如坠冰窖，他一面怒骂霹雳军阴险狡诈周见深不讲信义，一面乞求纽璘发兵援助眉州城。之前他认为彭山降蒙之后，眉州城自然高枕无忧，故眉州城及下属的各县并没有多少兵力，甚至连城头不少的火炮也被他带去攻打嘉定城，那里抵挡得住霹雳军的两路进攻。更主要的是眉州城一失，必然会影响士气甚至会让士兵哗变。刘大耳手下的士兵多是眉州及下属各县人氏，被强征入伍本就有怨气，如果妻儿老小再落入霹雳军手中，自然会军心不稳。
嘉定城地形险要易守难攻，加之昝万寿指挥得当，又有霹雳军火器的支持，蒙军虽然人数是守军的数倍，却也攻不进城中。值得一提的是，俞三带领霹雳军特种连虽然人少，却扮演着救火队的解色，多次在关键时刻用火器瓦解了蒙军的攻势，让嘉定城化险为夷。成都蒙军水军被诈降的霹雳军重创的消息，气得纽璘浑身发抖。急切之间攻不下嘉定城，又见眉州有警，纽璘只得同意了刘大耳的请求，让他带兵回眉州救援。为了应对霹雳军南下，他又调了五百骑兵到岷江西岸，会同原有五百骑兵一同回援眉州守军。
刘大耳带着手下沿水陆两路往眉州赶。只不过回程是溯水而上，速度根本快不起来。陆路虽然是轻装疾行，但嘉定离眉州近两百里，这个距离即便是骑兵也要两日。刘大耳手下的精兵需要三至四日才能到达，其强征不久的士兵则需要更长的时间，而且急行军到达眉州之后战斗力将大幅下降。反观彭山至眉州却只有四十里地，霹雳军步兵也可以做到朝发夕至，而骑兵旅则半日便可到达。故霹雳军后勤辎重部队到达眉州城外，并开始构筑营垒之时，远方的官道上才出现零星蒙军的游骑，这些侦骑是忽都所率一千名骑兵的前锋。至于刘大耳所率的水军和步兵，则在至少二三日路程之外。
曹二狗下令在眉州城外构筑两个营垒，一个面对眉州城，一个面对嘉定方向，分别由一个步兵旅防卫。骑兵旅则在两个营垒的掩护下伺机出击。据侦察，眉州城守军不过数百人，加上被驱赶来守卫城墙的民壮，也不过三千人。在他看来，要拿下眉州城易如反掌，只需重炮一轰，步兵一冲锋便可拿下，唯一所虑者便是蒙古骑兵趁野战师攻城之时从背后偷袭。当下他便派人与乐全安联系，由野战师全力应对蒙古骑兵，攻城则由水军旅负责。