星忆圣殿守护宇宙的数个世纪后，银河系边缘频繁出现神秘的「时空劫掠」事件。整片星云在瞬间消失，只留下量子态的残影，而受害者的记忆中都残留着相同的画面：一支由半透明舰船组成的舰队，舰身布满类似星烬同盟标志的扭曲纹路。星熵之心的警报系统显示，这些劫掠与某个正在吞噬时间线的「量子裂隙」密切相关。
琉影率领精锐小队追踪线索，在一片荒芜星域发现了若隐若现的幽灵舰队。当他们试图靠近时，舰船突然释放出「时间锚定弹」，将周围空间凝固成量子果冻状。更诡异的是，舰队旗舰的轮廓竟与初代守护者驾驶的「星辉号」如出一辙，舰桥处闪烁的紫色幽光中，隐约可见熟悉的身影在操控着一切。
深入调查过程中，小队成员陆续遭遇「身份倒影」现象。他们的身体开始浮现出平行宇宙中自己的特征，记忆里交织着从未经历过的人生。琉影在与幽灵舰队的战斗中，被吸入一艘舰船的内部，竟遇见了「另一个自己」——对方自称是来自「熵寂结局」宇宙的守护者，因目睹文明灭绝而组建幽灵舰队，企图通过劫掠时空资源来改写命运。
星忆圣殿的档案系统突然自动开启，展示出被封存的禁忌历史：在远古时期，熵衡者文明曾进行过「跨时间线救援」实验，意外创造出会吞噬现实的量子裂隙。而眼前的幽灵舰队，正是失控实验产生的畸形产物，船员们皆是不同时空守护者的绝望残影。
为阻止量子裂隙的扩张，琉影联合全宇宙文明启动「因果织网计划」。科学家们建造「时间稳定锚」固定被劫掠的时空，艺术家们创作跨越维度的作品填补裂隙，而星烬同盟的舰队则驾驶装备「记忆共鸣炮」的星舰，与幽灵舰队展开殊死搏斗。
最终决战在量子裂隙核心爆发。琉影直面那位来自熵寂宇宙的自己，将星忆圣殿中所有文明的希望记忆注入对方意识。当绝望的残影们目睹无数个宇宙中文明的坚韧与新生，幽灵舰队的舰船开始崩解成发光的量子尘埃。而裂隙深处，一个由破碎时间线组成的巨型生物缓缓浮现，它正是吞噬一切的「时间噬者」。
琉影将星熵之心与星忆圣殿的力量完全融合，释放出能回溯时间的「星辉挽歌」。挽歌的旋律中，交织着知夏的咏叹调、夜影的声波共振，以及历代守护者的信念。当歌声触及时间噬者，它庞大的身躯开始逆向生长，最终化作一颗蕴含所有时间线可能性的「星痕种子」。
危机解除后，星痕种子在宇宙中心生根发芽，长成连接所有时空的「永恒星树」。每一片树叶都映照着不同宇宙的文明图景，每一根树枝都流淌着时间的记忆。琉影将星熵之心嵌入树心，创造出守护多元宇宙的「星痕中枢」。
在星痕中枢的光芒下，新的守护者们接过使命，继续守护着这片充满无限可能的星河。而在宇宙之外的某个未知维度，一个神秘的观测者轻轻拨动琴弦，新的故事，又将在星辉的轨迹中悄然开启......