在一个阴沉沉的日子里，柯南、毛利兰和毛利小五郎受到一位名叫山口百合子的女士邀请，前往她位于郊区的古老宅邸。山口百合子声称，最近她的宅邸里发生了一系列诡异的事情，希望毛利小五郎能帮忙调查。
当他们到达宅邸时，立刻感觉到了一股压抑的氛围。这座宅邸周围布满了茂密的树林，建筑风格陈旧而阴森。山口百合子神情紧张地迎接了他们，并讲述了事情的经过。
她说，最近几天每当夜晚来临，她都会听到奇怪的声音，仿佛有人在哭泣和低语。而且，她还在宅邸的各个角落里发现了一些扎纸人，这些扎纸人做得十分逼真，每个纸人身上都插着一根针，看起来十分诡异。
“我一开始以为只是有人恶作剧，但后来我发现这些扎纸人似乎在预示着什么。”山口百合子恐惧地说。
柯南仔细地观察了那些扎纸人，发现它们的样子和摆放位置都很奇怪。就在这时，突然传来了一声尖叫。众人赶紧循声跑去，发现山口家的女仆美惠子倒在地上，昏迷不醒，她的身边有一个扎纸人，纸人身上的针似乎比之前看到的更多了。
“这到底是怎么回事？”毛利兰惊讶地问道。
柯南在周围寻找线索，发现地上有一些奇怪的脚印，似乎是有人穿着特制的鞋子留下的。
在调查过程中，他们了解到山口家曾经发生过一些不为人知的事情。山口百合子的父亲曾经是一位富有的商人，但在多年前的一次交易中，他背叛了自己的合作伙伴，导致对方破产自杀。而那个自杀者的家人从此便消失了，不知去向。
“难道是那个自杀者的家人回来复仇了？”毛利小五郎猜测道。
随着时间的推移，宅邸里的诡异事件越来越多。又有几个仆人相继遭遇了类似的袭击，不是被吓得昏迷，就是身上出现了一些莫名其妙的伤口，而每次事件发生时，都会出现扎纸人。
柯南决定从扎纸人入手进行调查。他发现这些扎纸人所用的纸张和制作工艺都非常独特，似乎是来自某个特定的地方。经过一番周折，他找到了一位专门研究民间工艺的专家，从专家那里得知，这种扎纸人是一种古老的诅咒道具，传说可以用来索命。
“但是，这只是传说而已，不可能真的有这么神奇的事情。”专家说。
柯南并不相信诅咒的说法，他坚信这背后一定有人在搞鬼。在进一步的调查中，他发现山口家的一个远房亲戚山本最近行为异常。山本一直对山口家的财产觊觎已久，而且他曾经学习过一些民间工艺，有可能制作出这些扎纸人。
柯南和毛利小五郎开始暗中观察山本的一举一动。终于，在一个夜晚，他们发现山本偷偷地溜进了宅邸的地下室。两人悄悄地跟了进去，发现地下室里摆满了各种奇怪的道具和制作扎纸人的材料。
“果然是你在搞鬼！”毛利小五郎冲上去抓住了山本。
山本见事情败露，只好承认了一切。原来，他为了得到山口家的财产，利用了人们对扎纸人诅咒的恐惧，制造了一系列的诡异事件，想把山口百合子等人吓跑。他通过在夜晚假装发出奇怪的声音，放置扎纸人等手段，让大家陷入恐慌。而那些受伤的仆人，也是他故意袭击的，为的就是让事情看起来更加逼真。
“你以为这样就能得逞吗？”柯南愤怒地说。
最终，山本被警方带走，山口家的危机也得以解除。而这起扎纸人索命案，也成为了柯南他们记忆中又一个难忘的案件。