混元维度枷锁的裂痕如蛛网般蔓延，宇宙各处的监测站接连捕捉到异常的量子波动。在以「梦境与现实交织」为特色的「幻渊宇宙」，人们的噩梦开始实体化，街道上漂浮着由恐惧凝结的暗紫色雾霭，巨型梦魇生物肆意破坏城市；而以「记忆铸型」为文明核心的「溯忆宇宙」中，集体记忆库被暗紫色病毒入侵，历史档案被篡改，英雄变成恶魔，胜利被篡写成惨败，民众陷入认知崩塌的混乱。
秦逸的平衡印记传来灼烧般的剧痛，印记表面浮现出与混沌本源晶核同源的纹路。他意识到，之前消失的晶核并非遁入虚无，而是渗透进了宇宙的「本源脉络」——那是连接所有宇宙规则与能量流动的隐形网络。更令人不安的是，各个宇宙的智者们通过占卜与演算，得出相同的恐怖结论：混沌本源晶核正在吸收宇宙中的负面能量，试图与原初混沌海建立完整连接。
觉醒者们紧急召开全宇宙文明议会，却在会议途中遭遇突袭。暗紫色的能量裂缝在会场空间中撕开，混沌原始意志的残识化作无数虚影，蛊惑在场的文明代表：「秩序不过是短暂的幻觉，唯有回归混沌，方能获得永恒的自由。」部分意志薄弱的代表被同化，当场发动攻击，议会大厅陷入混战。关键时刻，秦逸激活终焉之剑的秩序之力，金色光芒驱散虚影，但裂痕已悄然在文明内部种下。
为了追踪混沌本源晶核，觉醒者们分为四支精锐小队。小女孩带领科技文明的顶尖团队，驾驶装备了量子定位系统的「追迹者号」，在宇宙的暗物质流中寻找晶核踪迹。他们遭遇由暗物质与混沌能量融合的「虚无掠食者」，这些生物能隐身于虚空中，突然发动攻击吞噬舰船的能源系统。小队利用反物质诱饵制造能量脉冲，才得以暂时击退敌人。
在幻渊宇宙，由梦境守护者与灵能者组成的队伍深入「噩梦核心」。他们发现，混沌力量正在将人类最深层的恐惧编织成「现实锚点」，一旦完成，噩梦将彻底取代现实。队员们不得不直面自己内心最黑暗的记忆——有人看到挚爱之人的背叛，有人重温种族灭绝的惨剧。一位年轻的灵能者在恐惧中险些崩溃，却在同伴的呼唤下，将恐惧转化为净化力量，用温暖的回忆之光驱散了部分暗紫色雾霭。
溯忆宇宙的记忆修复者们则潜入集体记忆库的底层，与篡改历史的暗紫色病毒展开数据战。他们操纵着由文明记忆具象化的「历史之刃」，在数据流的战场中厮杀。但随着战斗推进，病毒竟开始学习他们的攻击模式，局势陷入胶着。最终，一位古老的记忆守护者献祭自身所有记忆，释放出「本源回溯之力」，将被篡改的档案恢复如初。
秦逸独自深入宇宙本源脉络，这里漂浮着代表各个宇宙规则的光带，此刻却被暗紫色藤蔓缠绕。混沌本源晶核悬浮在中央，表面已形成类似眼睛的纹路，仿佛在凝视着整个多元宇宙。混沌原始意志的完整意识突然在此凝聚，化作一位身着暗紫色长袍的女性，她冷笑道：「秦逸，当晶核与原初混沌海共鸣，所有文明都将回归混沌的怀抱。」
战斗一触即发，晶核释放出「混沌终焉波」，本源脉络开始崩解，各个宇宙的规则出现紊乱。千钧一发之际，秦逸将全宇宙文明在危机中传递的信念之力注入平衡印记，同时唤醒初代神农封印在终焉之剑中的「创世余韵」。金色的光芒与暗紫色能量碰撞，在本源脉络中掀起剧烈震荡。
在激烈的对抗中，秦逸发现混沌本源晶核的弱点在于其与负面情绪的强连接。他通过精神网络向全宇宙发出最后的号召，无数文明放下仇恨与偏见，将希望、勇气与爱化作璀璨的能量洪流。这股力量注入终焉之剑，秦逸挥出「逆命混元斩」，剑光所至，暗紫色藤蔓寸寸崩裂，混沌本源晶核出现裂痕。
混沌原始意志发出绝望的嘶吼，试图引爆晶核与原初混沌海同归于尽。秦逸以自身为盾，用平衡印记强行压制爆炸。终焉之剑在超负荷运转中彻底碎裂，秦逸的身体也出现透明化的迹象——他正在与混沌本源晶核的能量同化。但在意识消散前，他成功将晶核封印进宇宙最边缘的「虚无之地」，并用最后的力量加固了混元维度枷锁。
当一切尘埃落定，多元宇宙迎来了久违的平静。破碎的终焉之剑被供奉在文明纪念馆，而秦逸的身影消失在星海之中，只留下一道若有若无的平衡印记光芒。但宇宙深处，原初混沌海传来低沉的脉动，仿佛在预示着，这场秩序与混沌的永恒博弈，仍将继续……