破碎的囚笼残骸在宇宙中飘荡，宛如冰冷的墓碑。秦逸将复苏中的林婉安置在临时搭建的医疗舱内，她石化的皮肤已褪去大半，但眉心间仍残留着一道银色锁链状的纹路。熵变之杖孕育的树苗在星云核心茁壮成长，枝干上流转着混沌与秩序交织的奇异光芒，却也吸引了不速之客。
“检测到异常能量波动！”裂缝文明的警报声骤然响起。星云边缘，无数闪烁着金属光泽的孢子群破空而来——那是由菌裔与机械技术融合的“共生孢子”，每个孢子表面都刻着火种派的禁锢符文。孢子群所过之处，星球植被迅速金属化，生命体被强制植入机械共生体。
“是火种派的‘机械菌裔’计划！”残缺派领袖的声音从通讯器传来，带着难以掩饰的震惊，“他们把石像守卫的残骸与医道菌裔结合，创造出了能同化一切的恐怖存在！”话音未落，孢子群已化作巨型机械藤蔓，缠绕住裂缝文明的旗舰。藤蔓表面的菌毯不断分泌腐蚀液，而金属骨架则精准攻击飞船要害。
秦逸握紧熵变之杖，杖身的混沌藤蔓自动延伸，与机械藤蔓缠绕绞杀。但诡异的是，当两种力量碰撞时，共生孢子竟开始吸收混沌能量，进化出更坚硬的外壳。林婉在昏迷中发出痛苦呻吟，她眉心的锁链纹路亮起，与孢子群产生共鸣——机械菌裔似乎将她视为“完美宿主”。
“不能让它们靠近林婉！”秦逸将归墟残能注入混沌藤蔓，爆发出足以扭曲空间的力量。熵变之杖的树苗突然摇晃，释放出一圈圈能量涟漪，暂时压制住孢子群。但树苗的叶片开始出现黑斑，仿佛在承受巨大的反噬。裂缝文明的科学家紧急分析数据，脸色惨白：“这些孢子在篡改树苗的基因链，它们想把混沌秩序树转化为共生母体！”
更糟糕的状况接踵而至。被孢子感染的星球上，诞生出了“共生医傀”——失去自我意识的生命体，兼具菌裔的超感医疗能力与机械的绝对服从性。这些医傀组成方阵，手持由自身骨骼锻造的手术刀，所到之处，无论伤者还是健康者，都会被强制“改造升级”。
“必须找到共生孢子的弱点！”秦逸在战斗间隙翻阅忏悔录，却发现书页上的文字正在扭曲重组。突然，一段模糊的记忆涌入脑海：初代神农曾用“矛盾之种”平衡相生相克的力量。他立刻调动熵变之杖，将混沌与秩序能量压缩成一枚黑色种子，投向孢子群中央。
种子爆炸的瞬间，产生了排斥一切同化的力场。共生孢子纷纷崩解，但剩余孢子却迅速融合，形成一个巨型机械菌裔母体。母体张开布满利齿的巨口，将附近三颗星球吸入腹中，开始批量生产共生医傀。林婉的心跳突然加速，她的身体不受控制地漂浮向母体——石像守卫残留的火种程序，正在强行将她与母体连接。
“不！”秦逸不顾一切地冲向母体，归墟残能在体表燃烧成黑色火焰。他挥动熵变之杖，斩断连接林婉的能量锁链，却被母体释放的孢子雨击中。腐蚀感从皮肤渗入骨髓，他感觉自己的意识正在被机械思维蚕食。千钧一发之际，裂缝文明的孩子们再次挺身而出，将全部痛觉能源化作防护罩，护住秦逸与林婉。
就在局势濒临绝望时，苏瑶药晶的碎片突然汇聚成一道光柱，直击巨型母体。药晶中传来空灵的声音：“共生不该是奴役，而是包容。”光柱所到之处，机械菌裔的金属外壳开始软化，菌毯纹路转变为温和的治愈图腾。母体发出不甘的嘶吼，分裂成无数小型共生体，逃向宇宙深处。
但危机并未解除。秦逸发现，那些逃走的共生体开始在星域间建立“共生祭坛”，祭坛表面的符文与林婉眉心的纹路如出一辙。更令人不安的是，混沌秩序树的黑斑仍在扩散，树苗根系中隐隐浮现出机械脉络。林婉终于苏醒，她望着星云外闪烁的祭坛光芒，轻声道：“我们创造了新的平衡，却也打开了潘多拉魔盒...这些共生体，正在寻找新的宿主。”
而在宇宙某个未知角落，一个身披黑袍的身影注视着这场战斗。他手中把玩着一枚融合了菌裔与火种技术的结晶，嘴角勾起冷笑：“有趣，是时候启动‘傀儡核心’计划了...”星云深处，共生祭坛的符文突然全部亮起，一场更大的阴谋正在黑暗中悄然酝酿。