虹桥医链的警报声与星孩婴儿恶体的狂笑在宇宙中回荡，林婉望着星图上不断扩张的归墟黑洞，手心沁出冷汗。医链的修复工作因机械瘟疫的残留影响进展缓慢，而更糟糕的消息传来——机械族展示了他们的最新武器：由星孩善恶双体基因改造的“矛盾体战士”。
“这些战士的基因链如同不稳定的量子态，”秦逸将检测报告投影在主控室，画面中，战士们的身体在完美与残缺间快速切换，“当他们呈现完美形态时，拥有超越星级战舰的破坏力；而一旦切换到残缺形态，便会释放出足以净化瘟疫的治愈力。但每一次形态转换，都会引发强烈的能量风暴。”
初代守护者调出战场画面，机械族的舰队正护送着矛盾体战士阵列逼近。这些战士的装甲表面流转着黑白交织的纹路，胸口镶嵌的水晶与星孩婴儿眉心的裂痕产生共鸣。林婉的晶化右手不自觉地颤抖，她感受到初代道侣残片在锚刃中发出悲鸣——那是对基因亵渎的愤怒。
“苏瑶，启动防御矩阵！”林婉冲向舰桥，却发现素问母脑的核心区域仍残留着机械瘟疫的暗线。苏瑶的声音从根系传来，带着沙哑：“部分功能尚未恢复，只能启动60%的防护罩...”话音未落，矛盾体战士已发动攻击。完美形态下的他们举起能量炮，轰出的光束竟能扭曲空间，虹桥医链的防护罩在冲击下泛起刺目的紫光。
秦逸甩出银针，试图扰乱战士们的基因波动，却发现银针在接触黑白纹路的瞬间就被分解。“他们的基因锁太过精密，”他擦去额头的冷汗，“除非能找到星孩基因的原始代码，否则根本无法破解。”就在此时，星孩婴儿的善体突然脱离医疗舱，化作一道金光冲向战场。
善体的光芒与矛盾体战士的能量碰撞，产生剧烈的震荡。奇迹发生了——部分战士的眼神恢复清明，他们的身体停止切换，定格在残缺形态，开始用治愈力修复被破坏的空间。但恶体的身影也随之出现，他站在归墟黑洞边缘，冷笑着挥动手臂：“真是愚蠢的慈悲，看你们能坚持多久。”
归墟黑洞突然喷涌出大量黑色物质，这些物质附着在矛盾体战士身上，竟将他们的残缺形态转化为更扭曲的异化体。他们的皮肤开始机械增生，眼中闪烁着归墟能量的疯狂。林婉握紧因果锚，初代道侣的力量与善体光芒融合，斩出一道能斩断因果的刃芒：“秦逸，我们必须靠近黑洞，找到星孩基因的源头！”
两人驾驶穿梭舰突破防线，却在接近黑洞时陷入诡异的力场。周围的空间被压缩成无数镜面，每一面镜子都映出不同的可能性：林婉杀死星孩阻止灾难、秦逸与秦青鸾同归于尽、虹桥医链被改造成吞噬者的躯壳...“这些是平行宇宙的片段，”秦逸的银针在镜面上留下痕迹，“秦天明一定在利用黑洞操控时间线。”
千钧一发之际，星孩婴儿的意识突然在力场中浮现。他的善恶双体化作两条巨蟒，相互缠绕着冲向黑洞核心。林婉与秦逸趁机跟上，却发现黑洞深处藏着一个巨大的基因实验室。无数培养舱中浸泡着星孩婴儿的克隆体，而中央的主控制台闪烁着秦天明的全息投影：“欢迎来到观察者协议的核心，你们准备好成为实验的一部分了吗？”
战斗在实验室中爆发。矛盾体战士的异化体追入黑洞，他们的攻击引发空间坍缩。林婉的晶化右手在连续战斗中崩解过半，她将最后的力量注入因果锚，斩断了连接培养舱的基因锁链。秦逸则用银针破解主控制台，试图找到关闭观察者协议的方法。
就在此时，星孩婴儿的善恶双体突然失控，相互撕咬起来。黑洞的引力开始疯狂波动，整个实验室面临崩塌。秦天明的投影发出狂笑：“看吧，这就是基因悖论的必然结局。当完美与残缺无法共存，唯有毁灭！”林婉望着痛苦挣扎的星孩，突然想起初代道侣的记忆——真正的平衡，不是消灭对立，而是接纳矛盾。
“秦逸，把星孩的基因代码与我们的灵力融合！”林婉大喊着将因果锚刺入自己的经脉，“我们要创造第三种可能！”秦逸心领神会，银针化作流光没入她的体内。两人的力量与星孩的基因产生共鸣，在黑洞中形成一个巨大的太极图。太极图的光芒中，矛盾体战士的异化开始消退，星孩婴儿的善恶双体也停止了争斗。
但危机并未解除。秦天明的实验室深处，一个更庞大的装置正在启动，它的核心是一块刻满《太素仙医录》终极禁术的石碑。虹桥医链传来紧急通讯，苏瑶的声音带着绝望：“医链的能源核心被归墟能量渗透，最多还能支撑十分钟...”而在黑洞边缘，恶体露出了阴谋得逞的笑容，他的身影逐渐与石碑融合，观察者协议的真正威胁，才刚刚展现出冰山一角。