永安二年（公元 259 年）春正月，天上又打雷又闪电，天气异常。
三月，孙休下令配齐九卿官员，还下了道诏书说：“我没什么德行，却坐在王公之上的位子，整天提心吊胆，连睡觉吃饭都顾不上。现在想停止战事、提倡文治，来推崇良好的教化。要实现这个目标，得让百姓富足，这就离不开农业和养蚕缫丝。管仲说过：‘仓库里粮食充足，百姓才知道礼节；衣食丰足，百姓才懂得荣辱。’一个男子不耕种，就有人要挨饿；一个妇女不织布，就有人要受冻。饥寒交迫还能不做坏事的百姓，从来就没有过。近些年，州郡的官吏百姓和各军营的士兵，大多不务正业，都乘船在长江上往来做买卖，良田渐渐荒废，现有的粮食一天天减少，这样想实现天下安定，怎么可能呢？这也可能是因为赋税太重，农民获利太少，才导致这种情况吧！现在想大力发展农业，减轻赋税，根据强弱来分摊徭役，按田亩数量征收赋税，务必做到公平合理，让官府和百姓都各得其所，使家家户户丰衣足食，能互相供养，这样百姓就会爱惜自身、重视性命，不违反法令，之后就可以不用刑罚，风俗也能整顿好。凭各位大臣的忠诚贤能，如果能尽心尽力做好当下的事，就算远古的盛世不能马上实现，汉文帝时的太平景象，或许还是能达到的。能达到的话，君臣都能荣耀；达不到的话，国家就会受损削弱、遭受屈辱，怎么能敷衍应付呢？各位卿相尚书，可以一起商议谋划，务必采取合适的办法。农耕养蚕的时节已经到了，不能耽误时机。事情定下来后就施行，以符合我的心意。”
永安三年（公元 260 年）春三月，西陵上报说出现了赤乌。秋天，采纳都尉严密的建议，修建浦里塘。会稽郡有谣言说孙亮会回来再当皇帝，而孙亮的宫女告发孙亮让巫师祈祷祭祀，说过恶毒的话。有关部门把这事上报，孙休把孙亮贬为候官侯，遣送他去封国。孙亮在途中自杀，护送的人都被治了罪。（《吴录》说：有人说是孙休用毒酒杀了孙亮。到晋朝太康年间，吴国少府丹杨人戴颙迎回孙亮的遗体，把他葬在赖乡。）孙休把会稽郡南部划出来设立建安郡，从宜都郡分设出建平郡。（《吴历》说：这一年在建德县得到一口大鼎。）
永安四年（公元 261 年）夏五月，下了场大雨，泉水河水都涨得往外溢。秋八月，孙休派光禄大夫周奕、石伟巡视各地风俗，考察将领官吏的清廉或贪浊，了解百姓的疾苦，然后下了升降官员的诏书。（《楚国先贤传》说：石伟，字公操，是南郡人。年轻时好学，修养节操从不懈怠，正直独立，有不可动摇的志向。被推举为茂才、贤良方正，都没有就任。孙休即位后，特地征召石伟，他逐渐升迁到光禄勋。等到孙皓即位，朝政混乱，石伟就以年老有病为由请求退休，被任命为光禄大夫。吴国被平定后，建威将军王戎亲自去拜访石伟。太康二年，晋朝下诏说：“吴国光禄大夫石伟，坚守清白的志向，到老都不改变，虽然身处危难混乱之中，廉洁的气节值得记载。他年纪已经很大了，经不起长途跋涉，任命石伟为议郎，加二千石的俸禄，直到他去世。” 石伟就假装疯狂和失明，不接受晋朝的爵位。八十三岁时，在太熙元年去世。）九月，布山上报说出现了白龙。这一年，安吴的百姓陈焦死了，被埋葬后，过了六天又活了过来，从土里钻了出来。
永安五年（公元 262 年）春二月，白虎门的北楼发生火灾。
秋七月，始新县上报说有黄龙出现。八月壬午日，天降大雨，雷电交加，泉水河水都涨得往外溢。乙酉日，孙休册立朱氏为皇后。戊子日，立儿子孙｛雨单｝为太子，大赦天下。
《吴录》记载了孙休的诏书：“人有名字，是为了相互区分，长大后给取字，是因为忌讳直呼其名。按礼仪，给儿子取名要让名字难犯又容易避讳，五十岁后称呼伯仲，古时候有的名字只用一个字。现在的人都争着用好听的名和字，还让名和字相互搭配，可行为却和名字不相符，就像那个叫伯明的瞎子，我曾嘲笑过这种事。有的名字是师友父兄取的，有的是自己取的；师友取的还说得过去，父兄取的就不太合适，自己取的就最不谦虚。我现在给四个儿子取名取字：太子名叫｛雨单｝，｛雨单｝的读音就像湖水湾澳的‘湾’，字叫莔，莔的读音就像迄今的‘迄’；二儿子名叫 {雷大}，{雷大} 的读音就像兕觥的‘觥’，字叫｛西升｝，｛西升｝的读音就像玄礥首的‘礥’；三儿子名叫壾，壾的读音就像草莽的‘莽’，字叫昷，昷的读音就像举物的‘举’；四儿子名叫，的读音就像褒衣下宽大的‘褒’，字叫□，□的读音就像有所拥持的‘拥’。这些名字和字都和世人常用的不一样，是抄录旧文拼凑而成的。文字的八种字体有增有减，都是根据实际需要产生的，现在造这些名字，既不相互搭配，字又只用一个，希望能容易避讳，现在把这些普遍告知天下，让大家都知道。”
臣松之认为，经传中说 “名字是用来制定道义的，道义是用来产生礼仪的，礼仪是用来体现政治的，政治是用来端正百姓的。所以政治成功百姓就会听从，改变就会产生混乱”。这话可不是凭空说的啊！孙休想让名字难犯，还怕没有合适的名字，却造出这些没道理的字，制定不合规范的读音，违背前代贤明的教诲，给后代留下笑柄，不也太奇怪了吗！所以他死后尸骨未寒，妻子儿女就被消灭了。师服的话，在这儿得到了验证。
冬十月，孙休任命卫将军濮阳兴为丞相，廷尉丁密、光禄勋孟宗为左右御史大夫。孙休因为丞相濮阳兴和左将军张布有旧恩，把政事托付给他们，张布掌管宫廷事务，濮阳兴参与军国大事。孙休专心钻研典籍，想通读百家着作，尤其喜欢射野鸡，春夏之间常常清晨出去，夜里才回来，只有这个时候才放下书。
孙休想和博士祭酒韦曜、博士盛冲讲解谈论儒家学问，韦曜、盛冲向来都正直敢言，张布担心他们入宫侍奉，会揭发自己的隐私过错，让自己不能专权，就编造谎言来阻止。孙休回复说：“我在学问上的涉猎，群书大致都读遍了，见识也不少；那些明君昏君，奸臣贼子，古今贤愚成败的事迹，没有没读过的。现在韦曜等人进来，只是想和他们谈论书籍罢了，不是要跟着韦曜等人重新开始学习。就算是重新学习，又有什么损失呢？你只是因为韦曜等人恐怕会说臣子下的奸邪变故之事，因此不想让他们入宫罢了。像这样的事，我自己已经有所防备了，不需要韦曜等人说然后才能明白。这都没什么损失，你心里只是有所顾忌罢了。”
张布收到诏书后谢罪，又重新为自己辩解，还说担心妨碍政事。孙休回复说：“读书的事，怕的是人们不喜欢，喜欢读书并没有坏处。这没什么不对的，可你却认为不合适，所以我才说这些。政务和学业，它们的门类不同，不会相互妨碍。没想到你如今当权，却对我做这种事，实在是不可取。” 张布上奏表叩头请罪，孙休回复说：“只是开导你罢了，何至于叩头呢！像你这样的忠诚，远近的人都知道。过去之所以能相互感召，才有了今天的显赫。《诗经》说：‘没有好的开始，很少有能善终的。’善终实在很难，你要善终啊。”
当初孙休做琅邪王时，张布是左右将督，向来受到信任宠爱，等到孙休即位，对他更加宠爱优待，张布专擅国政，做了很多无礼的事，自己也嫌弃自身的缺点，害怕韦曜、盛冲说出来，所以特别忌讳。孙休虽然明白他的意思，心里却不高兴，又怕他疑虑恐惧，最终还是顺从了张布的意思，废止了讲论学业，不再让盛冲等人入宫。这一年，孙休派察战到交址去征调孔雀、大猪。
臣松之按：察战是吴国的官名，现在的扬都有察战巷。
永安六年（公元 263 年）夏四月，泉陵县上报说有黄龙出现。五月，交址郡吏吕兴等人反叛，杀了太守孙谞。孙谞在此之前征收郡里的手工艺人一千多人送往建业，而察战到了之后，吕兴等人担心再被征调，所以趁机煽动士兵百姓，招诱各夷族反叛。
冬十月，蜀国因为被魏国讨伐前来告知。癸未日，建业石头小城发生火灾，烧毁西南面一百八十丈的地方。甲申日，孙休派大将军丁奉统领各路军队前往魏国的寿春，将军留平另外到南郡去见施绩，商议军队的进军方向，将军丁封、孙异到沔中，都是为了救援蜀国。后来蜀国君主刘禅投降魏国的消息传来，这些军事行动才作罢。吕兴杀了孙谞后，派使者到魏国，请求派遣太守和军队。丞相濮阳兴建议选取屯田的一万人作为士兵。从武陵郡分设出天门郡。
《吴历》说：这一年长沙出现青龙，慈胡出现白燕，豫章出现赤雀。