翡翠岛在海魂之心的庇佑下度过了三年宁静时光。新建的灯塔每晚都会散发出柔和的光芒，与鲛人族群种下的荧光珊瑚遥相呼应，将整片海域装点成梦幻般的世界。郭雅琴的兵工厂早已焕然一新，如今生产的武器融合了海族魔法与机械科技，成为守护岛屿的坚固壁垒。
这日清晨，郭雅琴像往常一样在了望塔上检查共振雷达，屏幕上的波纹规律而平缓。她刚松了口气，突然瞥见雷达边缘出现一丝异常波动——那是极其微弱的能量反应，若不是经过三年改良的设备，几乎难以察觉。“仙美空！快来看这个！”她立刻呼叫正在研究机械符文的同伴。
仙美空匆匆赶来，盯着雷达屏幕皱起眉头：“这股能量很陌生，既不是机械帝国的齿轮波动，也不像海蛇教的黑暗气息...倒像是...”她突然想起什么，脸色骤变，“和我们在神庙深处感受到的远古力量有点相似！”
消息很快传遍全岛。洛渊带领鲛人侦查队潜入海底，却在距离翡翠岛百里外的海域发现了令人心惊的景象：无数发光的孢子悬浮在海水中，每一颗孢子都包裹着细小的符文，它们正以诡异的规律排列，形成一个巨大的、尚未完全成型的魔法阵。
“这些孢子在吸收海洋中的游离能量。”洛渊返回后，鱼尾还在不自觉地颤抖，“如果让它们完成阵法，后果不堪设想。更奇怪的是，它们似乎在躲避海魂之心的光芒。”
郭雅琴召集众人商议对策，议事厅内气氛凝重。小顺子翻看着新记录的能量图谱：“郭姐，我发现这些孢子的活动时间都在深夜，而且每次出现前，海底都会传来一种奇特的声波，频率和...和小奶娃使用时空口袋时的波动有点像。”
这个发现让所有人心中一震。守海人的虚影适时出现，他的表情比以往更加严肃：“深海中沉睡着比机械帝国更古老的存在，那是连海神都选择封印的禁忌力量。如今海魂之心重归完整，或许唤醒了某些不该苏醒的东西。”他挥动法杖，空中浮现出一幅模糊的画面——黑暗的深渊中，一个巨大的茧状物正在缓缓蠕动，茧壳上布满与孢子相同的符文。
为了摸清孢子的底细，郭雅琴决定组建一支侦察小队。她带上改良后的磁暴分析仪，仙美空负责破解符文，洛渊则用鲛人天赋感知能量变化。当他们驾驶着“海魂二号”潜艇靠近孢子群时，分析仪突然发出刺耳的警报，屏幕上的数据疯狂跳动。
“小心！这些孢子会攻击！”洛渊话音未落，无数孢子如子弹般射向潜艇。仙美空迅速启动防护罩，可孢子接触到防护罩后，竟开始分泌腐蚀液。郭雅琴尝试用共振波驱散孢子，却发现它们在受到攻击后会分裂成更多个体。
混乱中，仙美空突然发现了关键：“这些孢子畏惧高频震动和强光！就像...就像它们是某种黑暗生物的幼体！”郭雅琴立刻调整武器，将磁暴能量与海魂之心的光芒结合，形成一道金色的激光束。激光扫过之处，孢子纷纷发出尖啸，化作黑色烟雾消散。
然而，他们的行动似乎惊动了幕后黑手。深夜，翡翠岛的结界突然遭到不明力量的冲击。无数触手状的黑影从海底伸出，缠绕在结界上，海魂之心的光芒被压制得忽明忽暗。郭雅琴望着天空中诡异的乌云，握紧了手中的共振枪：“看来我们的猜测没错，真正的威胁才刚刚开始。”
守海人再次现身，带来了更令人不安的消息：“深海中的茧已经出现裂痕，里面的存在即将苏醒。而那些孢子，不过是它用来测试我们实力的棋子。”他看向郭雅琴，眼神中带着期待与忧虑，“这次的敌人，拥有扭曲时空的力量，你们必须找到克制它的办法。”
与此同时，在海底深处，一只巨大的眼睛在黑暗中缓缓睁开，瞳孔中倒映着翡翠岛的方向。它周围漂浮着破碎的时空口袋残骸，而在残骸中间，竟有一个若隐若现的身影，那身影的轮廓，与消失的小奶娃有着惊人的相似......