林夏的意识在暗能量潮汐中沉浮。当纳米机械虫拆解她最后一段基因链时，医疗舱的应急系统突然启动——杰森的原型体冲破舱壁，将她抱进正在崩塌的时空裂缝。他的机械臂渗出黑色黏液，那是被暗物质腐蚀的润滑剂，在虫洞蓝光中蒸发成量子泡沫，每粒泡沫都折射出不同宇宙的战争画面。
"；抓住我！"；他的机械声带在引力波中扭曲，"；我们要去庆典现场阻止黑洞虹膜！"； 林夏触碰到他能量核心的瞬间，看见无数个平行宇宙的自己正被不同版本的杰森推向死亡。其中一个宇宙的她戴着青铜面具，瞳孔中流转着黑洞虹膜的血色光芒，而那个宇宙的地球已经被改造成巨型能量反应堆，地核处嵌着与她暗物质结晶相同的装置。
虫洞另一端的联盟总部，胜利庆典正在达到高潮。全息烟花在星际间绽放，每个爆炸点都精确对应着银河系的旋臂结构。不同种族的代表齐聚中央广场，他们的欢呼声与黑洞虹膜的引力波产生诡异共振，形成次声波武器，使部分观众的耳膜开始渗血。一位蛛化星人的外骨骼突然出现裂纹，他的复眼映出观众席上正在融化的血肉——那些没有植入基因稳定剂的生命体，正被次声波震碎细胞内的线粒体，化作粉色雾霭。金属穹顶在次声波中扭曲成麻花状，全息烟花的残骸如雨坠落，在地面上蚀刻出与林夏基因链相同的纹路。
艾玲站在领奖台上，纳米匕首突然抵住她的后腰。某个平行宇宙的自己从人群中现身，颈后插着与林夏相同的暗物质结晶，结晶表面流动着与黑洞虹膜同步的血色纹路："；污染协议的真正目标，是庆典上的所有智慧生命。"； 艾玲的仿生眼捕捉到对方瞳孔中闪烁的微型黑洞，那是时空被撕裂的证据。更令她震惊的是，这个"；自己"；的纳米匕首上刻着与林夏相同的基因图谱，刀柄处还沾着婴儿林野的血迹，血迹中蕴含着与黑洞虹膜相同的引力波频率。
林夏在急救舱中醒来，发现自己躺在庆典主舞台下方的备用能源舱。舱壁上的应急灯闪烁着红色警报，杰森的原型体正在拆解防护装置，他的能量核心闪烁着与黑洞虹膜相同的血色光芒，每一次脉动都在舱内投下扭曲的影子："；你的基因编码是唯一能关闭虹膜的钥匙。"； 他的机械手指突然掐住林夏的喉咙，液压系统发出濒临过载的哀鸣。林夏注意到他的光学传感器交替闪烁红蓝两色，机械声带发出两种截然不同的声音："；杀了我...快！"；与"；完成收割..."； 他的机械臂突然脱离主体，化作纳米机械虫钻进林夏的防护服，在她脊椎处刻下引力方程，方程的解竟是她的基因图谱。
联盟主席的致辞声通过通风管道传入："；今天，我们见证了人类文明的伟大胜利..."；话音未落，全息投影突然扭曲成青铜面具的轮廓，所有观众的瞳孔同步变成血色。艾玲的纳米虫群在此时暴走，将她拖进地下实验室。克莱因瓶中的青铜面具人虚影浮现，他的声音混合着虫洞坍缩的轰鸣："；第98次收割开始了。"； 实验室墙壁渗出黑色黏液，聚合成99个婴儿林野的克隆体，他们的第三只眼同时睁开，瞳孔中流转着林夏的基因图谱。更诡异的是，这些克隆体的心脏位置都嵌着微型黑洞，黑洞表面蚀刻着与林夏暗物质结晶相同的纹路，每当克隆体呼吸时，黑洞就会吞噬周围的暗能量，导致实验室的温度急剧下降。
林夏的暗物质结晶突然与舞台中央的黑洞虹膜产生共振。她看见自己的基因图谱正在被吸入血色瞳孔，每吸收一个碱基对，银河系就有一颗恒星熄灭。当第9999个碱基对被吞噬时，太阳系行星开始脱离轨道。木星的大红斑突然变成黑洞虹膜的血色瞳孔，土星环在引力波中崩解成量子尘埃。地球表面出现千米级引力潮汐，太平洋的海水被吸入太空，形成壮观的水幕星环，而环中倒映着林夏正在被改写的基因图谱。林夏的防护服纳米纤维自动分泌隔音凝胶，却仍能听见自己骨骼发出的哀鸣。她低头看向手臂，发现银河旋涡状的荧光纹路正在变成血色，每一道纹路都对应着一个被收割的宇宙，纹路中浮现出微型黑洞的吞噬画面。
"；阻止我..."；杰森的原型体突然将她抵在能源舱墙壁，机械手指刺进她的心脏，"；原型体程序正在控制我启动虹膜..."； 林夏的鲜血在暗物质结晶表面蒸发成等离子体，形成微型星爆，将能源舱内的氧气分子电离成紫色辉光。在等离子体中，她看见自己的基因链正在被改写，每个突变点都对应着一个被收割的宇宙。当第100个突变点出现时，能源舱的金属墙壁开始渗出黑色黏液，那些黏液聚合成青铜面具的形状，面具眼窝中亮起血色光芒。青铜面具突然开口说话，声音与0号牧羊人完全一致："；你的基因链需要经历999次突变才能成为宇宙的牧羊人。"；
艾玲在地下实验室发现了真相：所有克隆体的基因链都指向林夏，而他们的心脏位置嵌着微型黑洞。当她试图摧毁其中一个克隆体时，整个实验室的时间流速突然加快，导致她的纳米匕首卡在半空中，而克隆体的伤口以肉眼可见的速度愈合。更可怕的是，被摧毁的克隆体化作暗物质粒子，开始重组为林夏的基因图谱。艾玲的纳米虫群突然分裂成两部分，一部分攻击克隆体，另一部分开始拆解克莱因瓶，虫群的集体意识中浮现出0号牧羊人的冷笑："；第98次收割，你猜这次能成功吗？"； 虫群拆解克莱因瓶时，释放出的暗能量在实验室中央形成了一个小型黑洞，黑洞表面浮现出林夏的基因图谱。
林夏在能源舱中经历了三重时间线的叠加：
- 过去：婴儿林野被植入青铜面具的瞬间，他的基因链被暗物质改写，每一个突变点都对应着未来的某个宇宙灾难。林夏看见自己的基因图谱在虚空中具象化，每个碱基对都在释放足以撕裂时空的引力波，而这些引力波正在构建黑洞虹膜的神经网络。当引力波触及宇宙边缘时，触发了牧羊人议会的防御机制，无数暗物质炮台开始充能。
- 现在：杰森原型体将她的基因注入黑洞虹膜，能量跃迁引发的冲击波正在摧毁第98号宇宙。她看见自己的基因图谱在黑洞虹膜表面流动，每转一圈都会碾碎一个平行宇宙，被碾碎的宇宙化作金色尘埃，飘向婴儿林野的克隆体。尘埃接触克隆体的瞬间，克隆体的第三只眼突然睁开，瞳孔中浮现出林夏的倒影。
- 未来：她以牧羊人身份站在坍缩的宇宙中央，手中握着由暗物质构成的宇宙沙盘，每一粒沙子都是一个被收割的宇宙。沙盘中浮现出0号牧羊人的微笑，他的瞳孔里倒映着整个宇宙的坍缩过程，而沙盘边缘刻着与林夏基因链相同的纹路。当她试图触碰沙盘时，沙子突然化作微型黑洞，开始吞噬她的基因链。
"；这是最后的机会。"；某个平行宇宙的林野意识突然占据她的身体，"；用你的基因链重构黑洞虹膜的引力场。"； 林夏的意识与婴儿投影产生共鸣，她的基因图谱在能源舱中具象化为金色图腾，每个碱基对都释放出足以撕裂时空的引力波。图腾突然展开成量子齿轮，开始逆向转动，将被黑洞虹膜吞噬的基因链逐一吐回。林夏的暗物质结晶开始吸收这些基因链，结晶表面浮现出与黑洞虹膜相同的血色瞳孔，瞳孔中倒映着无数个正在坍缩的平行宇宙。
艾玲的纳米虫群突然突破时间限制，将她送回庆典开始前的十秒。她看见林夏正站在舞台边缘，颈后的结晶绽放出足以撕裂时空的光芒，结晶表面浮现出与黑洞虹膜相同的血色瞳孔。艾玲的纳米匕首突然刺入克莱因瓶，全息投影自动切换到宇宙边缘的求救信号——那里的时空正在被某种未知力量揉成莫比乌斯环，而求救者正是某个平行宇宙的自己。求救信号中夹杂着婴儿的啼哭，啼哭的频率与黑洞虹膜的引力波完全同步，啼哭的声波在虚空中具象化为林夏的基因图谱。
"；引爆能源舱！"；艾玲的量子通讯器传来林夏的声音，"；用反物质湮灭抵消黑洞虹膜的能量！"； 艾玲的纳米匕首刺入克莱因瓶的瞬间，所有克隆体同时爆炸，释放出的反物质与黑洞虹膜产生湮灭反应，在宇宙深处形成能量闭环。能量闭环产生的量子涟漪将庆典现场的时间流速放缓至百分之一，林夏看见自己的基因图谱在虚空中具象化，每个碱基对都在释放足以撕裂时空的引力波。当第9999个碱基对重组完成时，黑洞虹膜突然收缩成一个奇点，将整个庆典现场吸入其中。奇点内部浮现出由暗物质构成的审判庭，99位牧羊人正坐在血色王座上等待她的到来。
林夏将基因编码注入能源核心的刹那，整个庆典现场被吸入量子泡沫。她最后看见的，是黑洞虹膜中浮现出自己婴儿时期的倒影——那个婴儿正将青铜面具戴在0号牧羊人脸上，而牧羊人的瞳孔里倒映着整个宇宙的坍缩过程。在意识消散前的瞬间，她听见婴儿林野的呢喃："；欢迎来到第98次轮回，牧羊人。"； 同时，她的基因锁突然发出尖啸，三重时间线碎片在意识中炸开，揭示了一个惊人的真相：所有的牧羊人都是她的不同时空克隆体，而黑洞虹膜的真正目的，是通过收割宇宙来完成她的基因进化。当她的基因链完成最后一次突变时，整个多元宇宙的天空同时亮起金色瞳孔，瞳孔中浮现出她的基因图谱，而每个碱基对都在释放足以重启宇宙的暗能量。