朱载坖将王家屏送走之后，开始和朱翊釴商量有关部院堂官的调整事宜，不过部院就可以逐步进行调整了，不必过于心急，这点朱载坖还是很清楚的，同时也要看看内阁在调整之中的运作情况，这点也是很重要的。
沈鲤现在还没有入阁，朱载坖也需要观察沈鲤入阁之后对于内阁决策的影响，能否达到朱载坖平衡朝廷的需求，现在朝廷上的各方政治势力也开始蠢蠢欲动起来了，这点不足为奇，从申时行担任首辅以来，虽然尚且能够保证相对的公平，但是在官员的任用和政策的实施上，申时行不可避免的是偏向于乡党的。
同时由于申时行自己出身于商贾之家，在政策上和张四维有一定的继承性，就是重视发展商业，同时征收商税，强调商人在国家赋税当中的重要作用，这些政策在朝廷内部还是有一些反对的声音的，同时在具体的政策上，申时行积极扶持苏松等地的纺织业，准备将纺织业变成大明重要的出口产业。
这自然遭到了江西、两广、浙江、福建等地的反对，因为他们都有自己的特色行业，这些行业也在当地也都是非常重要的，他们对于申时行这种支持苏松的纺织工业和松江的港口的行为自然是极为不满的，尤其是两广，他们认为广州港在和南洋诸国的贸易中更加重要，朝廷要支持两广的各种工业的发展，各地的官员也当然都想为自己争取，这点是很正常的。
在朝廷的万众瞩目之下，沈鲤从南京回到京师，入阁办事，沈鲤自然是很低调的回来入阁办事的，内阁还是能够维持表面的平静，但是真实情况如何，还尚未可知，申时行等人和王家屏他们都是看沈鲤入阁办事之后的行为，再决定下一步的行止。
而沈鲤在入阁之后，确实是第一时间就给朱载坖整了一个大活，沈鲤向朱载坖上了一道奏疏，名为请速决西事以安国家以培元气疏，看名字就知道沈鲤奏疏的内容了，沈鲤在奏疏中认为，朝廷在西域的征战，已经数年之久了，朝廷每年花费的银钱以千万计，西北数省的轮输转运到现在不能停止，还要从河南等地调拨粮秣，半个大明因此不能休息，所以沈鲤请求朱载坖迅速了结西域战事，休养生息。
沈鲤的奏疏一上之后，很多官员都上疏附和，他们对于朱载坖对西域的经略早就有所不满的，但是之前没有重臣敢于上疏讨论此事，因为重臣们都很清楚，经略西域是朱载坖谋划已久，亲自实施的事情，在这个事情上去劝谏，朱载坖必然不会听从，反而会招致朱载坖的反感，朱载坖现在积威甚重，群臣是不敢轻易谏阻的，但是沈鲤上来的第一枪就对准了此事，根本不在乎朱载坖的感受。
对于沈鲤的奏疏，朱载坖直接予以留中，其他官员的上疏也一概予以留中不发，不予理睬，朱载坖想要看看，这些官员们对能够说出些什么来，面对朱载坖的这个态度，官员也继续上疏，申时行等辅臣也通过密疏的形式向朱载坖上疏劝谏此事，他们认为，群臣并非反对朝廷经略西域，但是朱载坖始终没有说明朝廷经略西域的范围是多大。
虽然朱载坖也提出了相应的口号，也就是所谓的念旧民涂炭之苦，复中国往昔之疆，但是这个往昔之疆的范围有多大，确实是没有一个具体的说法，申时行等阁臣们认为，应该给这个往昔之疆划定一个界限，作为朝廷经略西域的重点，朝廷不可能无限制向西域投入资源，朝廷的财政也确实是无法支应，所以申时行等人请求朱载坖为此事划定界限，这样朝廷也就不再就此事加以争论了。
朱载坖认为也确实是应该就此事予以讨论一下了，将西域的事情定个调，所以朱载坖命令召开国务会议，之前由军机处参谋军务总署从国防地理的角度准备相关的资料，解释朝廷经略西域的重要意图。
在一应事情准备完毕之后，朱载坖在无逸殿召集相关的重臣们一道商量西域的事情，内阁辅臣、军机大臣、各部院以及军机处各总署等衙门的堂官和六科都给事中等全部到齐，朱载坖首先命令军机大臣提督参谋军务总署李如松介绍西域的相关情况和朝廷现在在西域的对手。
西域的国防地理，主要还是以天山为重点，朝廷现阶段主意是以控制天山为主要的目的，天山以北，朝廷主要的对手就是卫拉特蒙古，现在官军已经能够制服蒙古人了，同时朝廷也在通过外交手段加以控制，对于西域北部来说，朝廷还是已经有了相对强势的控制，未来主要就是加强科布多等地的控制，将卫拉特部彻底控制住。
整个西域，在地理上呈现“三山夹两盆”的特征，西域最北部为阿尔泰山，中部为天山，最南部为昆仑山系。阿尔泰山和天山之间为准噶尔盆地，天山和昆仑山系之间为塔里木盆地。西域北部占据欧亚大陆的中心，为亚寒温带的大陆性区域。在水平地理带上，相当于中亚荒漠带，长而寒冷的冬天，西域北部要以准噶尔盆地为中心，东北为阿尔泰山系，西北为准噶尔界山，南为天山，向东逐渐过渡向蒙古高原。
这里一向是各游牧民族的起家发源之地，也是朝廷要重点控制的地方，汉代属匈奴右部和乌孙，后鲜卑、柔然、突厥等民族相继在此游牧。唐代设北庭都护府，元代设别失八里行省，都说明了此地的重要性，所以朝廷要以轮台府为中心，加强对于整个西域北部的控制，同时就是对于这些少数民族加以控制，严防其日后为大明之祸患，这点是非常之重要的。
如果说西域北部是为了防北虏的话，西域南部则是要御外寇了。