朱载坖在之前就已经明确表示过自己的态度了，就是不管如何，都要大力支持官军在西域的用兵，这点朱载坖的态度是十分之坚决，朱载坖已经命令五军都督府和练兵军务处，详细确定可以调动的官军数目，准备驰援西域，同时准备相应的粮秣物资等，这些都是朝廷必须要做的，虽然内阁对于此事并不是很支持，但是在朱载坖的强力推动之下，朝廷也开始了大规模的准备工作。
首先就是动支内帑在北方收储粮食，同时雇佣百姓在农险时节接力运输粮秣，囤积于肃州等处，等到来年天气转暖，由兵站都司再发运到西域去，除此之外，相关物资的准备和调运也必须提上日程，西域毕竟广大，朝廷要想真的控制西域，确实是需要大量的兵力才行，除了官军之后，还要迁移卫所，充实西域，保证朝廷对于西域的切实控制。
朱载坖预计从土默特部征调骑兵两万，再调动官军五万，还有辽东的女真人一万余，共计向西域增兵八万，使得朝廷在西域的兵力逼近二十万，这个数字无疑是极为庞大的，朱载坖之前不是没有组织过数十万大军的征讨，但是西域的后勤保障难度显然是极高的，所以对于朝廷来说，这次经略西域无疑是极大的挑战。
除了从内地直接转运物资之外，朱载坖也要求吴兑继续在西域收购粮食，同时开展屯田，减轻朝廷的负担，当然现在朱载坖最关心的还是李成梁进攻乌鲁木齐的战事情况如何了，如果朝廷能够在今年就夺取乌鲁木齐，明年开春就可以在乌鲁木齐等地予以屯垦了，这样的话三五年之后，朝廷凭借庭州、交河、哈密等处的粮食，就可以极大的缓解朝廷的运输压力，这点对于朝廷来说是很重要的。
所以朱载坖命令通政司和五军都督府，有关西域的塘报，在收到之后，立即转送西苑，朱载坖要立即予以批阅，同时除此之外，朱载坖还召见了从西洋回来的罗明坚，这位授命为朱载坖的钦差，前往西洋为大明搜罗各种工匠、学者和相关的书籍，这些对于大明来说是极为重要的。
虽然朱载坖已经设立了大明格物院，但是在理论的研究上，大明的突破是确实是不大的，大明善于的是总结经验，是很典型的经验科学，但是在理论上是有些欠缺的，所以朱载坖希望能够从西洋引进人才，翻译书籍，大兴格物之风，这是朱载坖一直很关注的事情。
罗明坚这次出使，得到了教廷的大力支持，他作为大明皇帝钦差的身份在西洋是很吃香的，教皇认为这是很大的进步，当然也少不了罗明坚自己的吹牛逼，他向教廷宣称他是朱载坖的亲信臣子，奉大明皇帝之命到西洋来招揽人才的，同时他所携带的各种来自大明的织锦、瓷器等物资也证明了罗明坚确实是在大明混得不错，所以罗明坚还真的从西洋网罗了一帮人才到大明来。
朱载坖命令罗明坚协助朱载堉等人对于这些人加以安置，工匠等安排到文思院、军器监等相关衙门予以使用，而学者这安排到格物院予以交流，同时命令同文馆翻译罗明坚所带回来的相关书籍，这次罗明坚从西洋带回来的人当中，有一个是朱载坖比较重视的，就是伽利略，此公精于物理、算学、天文，虽然年轻，但是朱载坖很清楚他的价值，同时罗明坚还向朱载坖奏报了现在西洋的相关情况。
教廷为了维护自己的权威，对于异端正在实施严厉打击，成立罗马异端裁判所，对整个天主教世界的宗教审判所保有监督权。罗马异端裁判所由教皇直接管理，教皇委任六名红衣主教构成一个中央法庭，称为神圣罗马公教异端裁判部，这个机构要求认罪的被告进行公开悔过的苦行，包括自我鞭打，到圣地朝圣，罚款还有穿着表示被判刑者身份的服装。此外严重者还会被没收财产以及监禁，教廷现在重点打击的就是哥白尼的日心说。
教廷认为地球是上帝创造的宇宙中心，人类在地球上居住，而哥白尼的理论削弱了这一中心观念。故而对其进行批判，而在大明，反而并没有相关的争论，所以罗明坚将这些被教廷视为违禁的书籍也带回了大明，正在同文馆进行翻译，和教廷不同，朱载坖对于这想法和人反而是极为宽容，甚至命令罗明坚招募这些人到大明来，反正他们在西洋日子过得也不好，到大明来朱载坖愿意资助他们进行研究。
罗明坚也向朱载坖重点推荐了伽利略，认为他是一个天才，在隆庆二十三年，他利用斜面将g的测定改为测定微小加速度a=gsin θ，θ是斜面的倾角。朱载坖对于他是很感兴趣的，甚至抽出时间让朱载堉、陈大位等人和翻译带着此人前来陛见，要亲自召见他。
朱载坖在西苑召见了伽利略，询问了测定重力加速度的办法，同时对于重力加速度的看法，朱载坖敏锐的发现了伽利略虽然知道了重力，对于动量等也有一些研究，但是有些不成体系，所以朱载坖随即指出了三点：第一，一切物体在没有受到力或合力为零的作用时，总保持静止状态或匀速直线运动状态。第二，物体在受到合外力的作用会产生加速度，加速度的方向和合外力的方向相同，加速度的大小与合外力的大小成正比，与物体的惯性质量成反比。第三，两个物体之间的作用力和反作用力，在同一条直线上，大小相等，方向相反。
对于朱载坖所提出来的这三条，朱载堉、伽利略等人无异于振聋发聩的，开玩笑，牛顿三定律，朱载堉也不得不说道：“陛下真生而知之者也！”
朱载坖只是笑着说道：“朕只知其然，不知其所以然也，其他的事情，还是要卿等来做。”