现在朱载坖最关心的就是俺答的身体状况，朱载坖希望俺答能够再撑一段时间，给大明休整和准备的时间。
所以在结束了和练兵军务处的会议之后，朱载坖召见了锦衣亲军都指挥使陆绎，要求他加强打探俺答的圣体情况，一旦俺答真的去世，要尽快传递情报回大明，给朝廷足够的处置时间。
同时朱载坖命令从太医院赏赐顺义王药品等物，并且告知俺答和三娘子，若是紧急情况需要用药的话，可以直接向宣大守臣去信，朱载坖已经下旨给宣大守臣，只要顺义王用药，务必全力保障。
朱载坖现在还不想俺答去世，最好能够再活一两年，给大明争取时间。
把汉那吉回到土默特之后，向俺答传达了朱载坖的旨意，还有大明朝廷的各种赏赐，俺答仍然命令把汉那吉负责掌管和大明的互市，同时将土默特部的日常事务交给了三娘子，俺答则是只有的部落的重大决策时才会出现，似乎皈依佛法，为索南加措兴建了草原上第一座寺院，和首领们一道听索南加措讲经。
朱载坖命令锦衣亲军将有关套虏的相关资料搜集整理后，发给参赞军务大臣们，让他们通过密疏的形式向朱载坖条陈上疏此事，同时，朱载坖自己也仔细查看有关套虏的相关情报。
大明所称的套虏，就是鄂尔多斯部，和土默特部的关系是很亲近的，鄂尔多斯的头领是吉能，鄂尔多斯部首领吉能跟俺答汗一样也是达延汗三子巴尔速孛罗特后裔，跟土默特、喀喇沁、永邵卜一样是右翼诸部之一，算起来，吉能和俺答是堂兄弟的关系。
在同俺答达成封贡之后，鄂尔多斯部不像俺答那样消停，因对抚赏额意见不一，和大明开始出现摩擦。鄂尔多斯部多次向朝廷埋怨抚赏额的不公，要求增加抚赏额，他们认为他们也要享受和俺答一样的待遇，这在朝廷和朱载坖看来是绝不可能的，俺答可是顺义王，你吉能不过是都督同知，怎么可能等量齐观。
吉能在给朝廷的上疏中公然宣称：“臣与顺义王、青把都鼎足为三，今宣大甚厚，而延绥独薄，是以未服。”
吉能认为自己要和俺答享受一样的待遇，其中跳的最厉害的就是庄秃赖，他是吉囊六子的班札喇卫征诺延的次子，住牧在延绥边外，他是鄂尔多斯部中最激进的人，他已经多次挑衅大明了，尽管俺答也曾经约束过鄂尔多斯部，不过鄂尔多斯部本身就很松散，即便是吉能也很难将整个部落加以约束。
朱载坖认为，对于这种小部落，要采取强硬措施，亮明大明的态度，朱载坖随即下旨给三边总制方逢时，要求他派人到吉囊的营帐，明确告知他，要是庄秃赖再不收敛，大明官军就要捣穴了，对于蒙古人，要软硬兼施，一味的妥协或者打击都是不行的。
朱载坖正在处理政务，总督京营戎政曹国公李庭竹求见，李庭竹这次求见是因为哱拜的事情，朱载坖之前命令将哱拜升任三千营副将，连带他的家丁都编入三千营，现在哱拜已经率领他的近两千家丁抵达京师了，李庭竹是来请示应该怎么处理哱拜的。
朱载坖想了一下说道：“这样吧，你去传朕的旨意，令潞国公参赞军务大臣马芳前往阅视，看看哱拜所部的成色再说。”
李庭竹领旨之后赶紧去找马芳，马芳去城外查看了哱拜的家丁之后回来向朱载坖复旨了，朱载坖问道：“潞国公看了哱拜的家丁，如何？”
马芳对于哱拜的家丁评价还是不错的，哱拜的这小两千家丁，都是精壮之士，所拥有的战马也都是河套骏马，士卒马术精湛，各项武艺精熟，只要加以训练，确实可以成为一支强兵。
朱载坖问道：“以潞国公之见，应该如何区处哱拜及其麾下。”
马芳向朱载坖陈述了自己的看法，无外乎两种办法，第一就是将哱拜的家丁打散，分散到三千营各营之中，这样做的好处是哱拜的家丁可能闹事的风险被降到最低了，不可能再出什么事情，但是这会显得朝廷对哱拜十分防范。
其二就是从其余各营抽调精骑，补充进哱拜的家丁中，看似增强了哱拜麾下的实力，实则掺沙子，这样的话可以笼络哱拜。
朱载坖想了一下问道：“这个哱拜如何？”
马芳说道：“哱拜还是不错的，作战勇猛，熟悉边情，尤其是对于河套，是很熟悉，日后要是复套的话，哱拜就可以派上用场。”
朱载坖于是说道：“那就给他个参将，补足三千人，令其在三千营统领一军，但是要把他盯好了。潞国公认为哱拜有反心否？”
马芳赶紧领命，朱载坖对于哱拜，现在肯定是不能完全信任的，这孙子毕竟是降将，不过马芳到时认为哱拜不大可能会反叛，因为哱拜自从投靠大明以来，为大明屡立战功，哱拜可谓是踩着蒙古人的人头上位的，他怎么反叛？反叛到蒙古去？显然不可能，蒙古人恨之入骨。
而且从马芳和哱拜的接触来看，哱拜还是比较憨直的一个人，朱载坖于是说道：“哱拜及所部家丁万里驱驰，远来投效，朕甚嘉之，内帑发银五千，赏赐哱拜及麾下军士。”
对于哱拜，朱载坖决定先采取怀柔的方式，要是不行朱载坖也有办法收拾他。
除了这些事情之外，就是文思院使工部左侍郎严世蕃奏称：镇、定二舰，已经完工，只待火炮铸成，即可交付水师。严世蕃想请朱载坖亲自驾临天津，查看这两艘大明最大的军舰。
还有就是礼部尚书出缺一事，赵贞吉致仕之后，朱载坖令礼部左侍郎潘晟暂署部事，高拱上疏请求廷推吏部、礼部尚书，同时向朱载坖请辞署吏部事。
朱载坖于是命令吏部左侍郎陆光祖廷推吏、礼二部尚书。