朱载坖为此专门召见了东阁大学士、翰林院掌院学士殷士儋，和他商量诏书的事情，朱载坖对于这份诏书还是很重视的，要求殷士儋亲自主抓此事，弄出一篇令朱载坖满意的诏书来，朱载坖要举行隆重的拜将出师仪式，以振奋军心。
朱载坖甚至对于诏书的内容有明确的指示，要有大明出兵讨伐的正义性，还有大明对女真用兵的缘由，这些都要说清楚，务必要是一篇雄文。
在朱载坖的亲自干预下，殷士儋督促翰林院拿出以一份朱载坖还算满意的诏书。
同时在处理隆庆四年的一应礼仪活动后，朱载坖和内阁以及礼部尚书高仪、兵部尚书霍冀商量组织命将出师的仪式，因为大明自仁宣之后就很少大规模出击了，所以这种仪式很久都不组织了，所以朱载坖猛的问起此事，连高仪都很陌生。
但是既然是朱载坖问起此事，一众臣子们也赶紧将成祖时的命将出征仪式找来，加以改动，用以适应现在大明。
朱载坖原本准备亲赴三屯营，送大军出征，但是这个想法被大臣们坚决劝阻了，他们认为朱载坖是皇帝，是君上，哪有君上亲自前往去送麾下的士卒出征的呢？应该将出征的大军调至京师，朱载坖就在京师为大军送行即可，之前校阅京营的校场正好可以用来使用。
朱载坖在重臣们劝说之下，才放弃了这种想法，传令汪道昆、戚继光将参战部队带到京师来，准备誓师出征。
同时汪道昆在接到朱载坖命令之后，也和王兀堂取得了联系，汪道昆在给王兀堂的信中表示，自己已经知道了相关的情况，大明皇帝也知道了相关的情况，只要王兀堂肯定谨守本分，自己抵达辽东，剿灭觉昌安之后，就会重新在宽甸六堡开市，以满足王兀堂部的各种需求。
汪道昆还暗示王兀堂，只要王兀堂愿意忠于大明，那么在剿灭觉昌安之后，汪道昆可以扶持王兀堂做女真之主。为了稳住王兀堂，汪道昆向朱载坖上疏，请求先给王兀堂一点甜头，稳住他，然后才好对觉昌安用兵。
朱载坖经过与内阁商量之后，下达旨意，升王兀堂为都督佥事建州左卫指挥使，成为所谓的女真都督，同时加王兀堂为龙虎将军，从地位上显示大明对于王兀堂的关系，而且将原来由觉昌安担任的建州左卫指挥使给了王兀堂，也有挑拨他们二人关系的意图。
当然，光有这些头衔是远远不够的，朱载坖很清楚，对于这些蛮夷首领，还是实际的好处最有用，所以不仅有地位的提升，还有实际的利益才行，经过朱载坖与内阁、汪道昆等人商量，决定给王兀堂敕书五百道，这些敕书就是可以到大明在边境的马市交易的凭证，有了敕书，才能够到大明的马市中去交易。
这些敕书对于王兀堂来说还是有实际作用的，只要他还不想反叛，这些敕书就能够在日后发挥巨大的作用，这样做既可以避免直接给王兀堂物资从而导致资敌。
不仅是汪道昆给王兀堂做工作，辽东总兵黑春还利用自己出身于建州部的身份，积极的劝说王兀堂，希望他和大明站到一起，在汪道昆、黑春的劝说和威胁之下，王兀堂终于再次上疏大明，重申自己不敢背叛大明。
虽然现在天气严寒，海运无法进行，但是在朱载坖的严令之下，各项有关于东征的准备工作已经开始了。
大量的粮秣、军器、弹药等物，通过山海关向向广宁转运，在沈阳中卫，官军也修复了沈阳中卫的城防设施和仓库，准备储存从内地解运来的各种物资。
除了军粮、弹药之外，朱载坖另外一个关心的就是医疗情况，虽然大明官军中也有军医，但是数量实在是太少，质量也是十分的堪忧，以大明最精锐的京营来说，神机营、三千营、五军营各营有一名医官，两到四名医士，算下来一万名士卒中也没有一名医生。
虽然按照制度，边关卫所及人聚处，各设医生、医士或医官，俱由本院 （太医院）试遣。岁终，会察其功过而殿最之，以凭黜陟。但是实际上大部分的军营中是根本没有军医的，这也导致官军士卒身体状况堪忧，军营屡发疫病，影响官军的战斗力，同时由于缺乏军医和药材，也导致很多伤病士卒得不到及时的救治，影响军队的士气。
朱载坖之前就命太医院招考天下的医学生和命令地方举荐良医，现在太医院有经过徐伟、万密斋、李时珍的考核通过的地方良医近百人，医学生一千余人。
朱载坖命令太医院抽调善于治疗外伤的良医和医学生，随军出征，救治伤病士卒，同时还从内承运库拨银五万两采购药材，制成金疮药等治疗外伤所急需的药物，先期运抵辽东，就在沈阳中卫开设医院，将前线的伤病士卒在战时同意后送到沈阳中卫予以救治。
同时命令戚继光等人，从每队士卒中选拔一名聪明伶俐的士卒，到太医院接受简单的培训，学会简单的包扎等方法，在战时将伤员紧急处理，便于后面抢救伤员，朱载坖很清楚，对于伤员的救治关乎士气，轻忽不得。
所以朱载坖重申了太祖时期制定的军律：凡报伤病者，不论大小衙门，启闭冗暇，即时投入。如有把门人阻拦，及将官施行迟误者，罪坐所由。报病迟过一日者，罪在报迟之官；若因迟报致病兵身死者，究其迟误之人以军法。
而且对于野战医疗救护和战伤平定，朱载坖也和杨博、霍冀、万密斋、徐伟等人商量了一套详细的办法：凡弓箭伤系致命处为一等，虽重不开超等，被中三箭以上，虽轻亦开一等；中二箭者，虽轻不开三等。凡在手足间为二等，箭入不深，再轻者为三等，再轻者四等。致其刀伤当面者为超等；伤手是重者为一等，轻者为二等、三等止。
这些战伤的评定和战后的奖赏抚恤密切相关。