杨博于是向朱载坖解释了自己要推王崇古原因，杨博认为，王崇古之所以担任巡抚浙江都御史，是因为要用王崇古剿除倭寇，王崇古长于军务，这也是当时为什么以王崇古为巡抚浙江都御史原因之一，同时这也是杨博推荐王崇古为协理京营戎政的原因。
京营作为京师的倚仗，必须要振作起来，朱载坖对于京营十分重视，王崇古也算是知兵的臣子，让他担任协理京营戎政也算是合适的人选。
同时杨博确实是有私心的，杨博的私心主要是他想把王崇古从浙江调出来，避免陷入浙江清丈的漩涡之中，他很清楚，清丈田亩肯定是一个得罪人的事情，杨博不想让王崇古卷入到此事之中去，这个事情，确实是很难做，若是不是认真做，朱载坖不满意，可是若是真的认真去做，是肯定会得罪这些士绅们的。
浙江也是大明的科举大省，朝中的浙江籍官员很多，之前的严党中的赵文华，还是嘉靖朝的越中四谏，王守仁等都是出身于浙江的，得罪了他们对于王崇古来说不是一件好事，而且王崇古以军功出身，对于这些地方民政事务并不是他擅长的，杨博认为还是将他调来担任协理京营戎政比较稳妥一点。
对于杨博的考虑，朱载坖并不意外，现在王崇古毕竟是醋党的后起之秀，杨博要稳妥一些也是正常的，朱载坖想了想说道：“那朕就从了杨尚书所请，升王崇古为兵部左侍郎协理京营戎政，升苏州知府蔡国熙为右佥都御史巡抚浙江。”
既然王崇古调到京师来，朱载坖就顺势将蔡国熙安排到浙江去，蔡国熙作风强悍，能够办清丈田亩这样的差事，让蔡国熙来推动还是不错的。杨博当即领旨办理了。
而户部也编列了隆庆四年的预算计划，在马森的强烈建议之下，朱载坖不得不暂时中止了在隆庆四年再招募组建四卫亲军的打算，全力保障辽东的战事，同时将一些不紧急的修整边墙计划也暂停了，整个隆庆四年的预算计划以四百万两为准，除了九边军费之外，主要的两处开支就是河工和辽东的战事。
马森为河工编列了七十五万两预算，主要是堤坝修建的工程费用和转移百姓安置的费用，另外一项大的开支就是辽东的战事，马森安排了六十五万两折色还有各种粮秣消耗二百万石。
经过朱载坖与汪道昆、戚继光等人商量之后，增加粮秣消耗到二百八十万石，同时折色增加到八十五万两之多，朱载坖将朝廷的收支已经预算交六科和都察院备案，要求都察院对这些预算加以监察，朱载坖加强了都察院和六科的监察权力。
现在都察院对于户部制定的预算，认为不妥的可以直接向朱载坖上疏，请求纠正，户科给事中对于预算也可以直接予以批驳，在预算的执行过程中，都察院各道御史在地方要监察朝廷拨款的使用情况，尤其是河工、边墙、军饷这样的事情，若是出现问题，不仅要追究地方官员的责任，当事的巡按御史等也要承担责任。
同时赋予巡按御史随时稽查州县衙门的账目的权力，要严格审核账目，严防贪墨。
处理完了这些事情，就是对辽东的战事问题，之前朱载坖已经下诏给王台、王兀堂等人，要求他们配合大明，共同出兵，剿灭觉昌安。王台迅速回应了大明，称愿意配合大明出兵，为大明提供支援。
而王兀堂的态度就有些暧昧了，首先就是王兀堂等了许久才向朝廷上疏，可见他内心也是很矛盾的，而且从王兀堂的奏疏中也可以看得出来，王兀堂现在内心是极其矛盾的，一方面他对于大明的出尔反尔是十分痛恨的，但是另一方面他很清楚，大明正在厉兵秣马，准备对辽东用兵。
一旦王兀堂应对不力，恐怕就会给整个部落带来祸患，这使得他难以抉择，在回复大明的奏疏中也显得模棱两可，一方面向朝廷再三表示忠诚，一面借此机会向朱载坖和朝廷陈述自己的苦处，王兀堂在奏疏中称大明的边境官员虐待王兀堂部，大明官员低价强买人参，女真人不服，官军重伤女真几十人。
还有索要贿赂等一系列的事情，王兀堂请求朱载坖重新在六堡开市，使得他的部落能够从大明获得必要的物资。
朱载坖召集重臣商量此事，王台自不用说，现在关键问题是王兀堂的问题，对于王兀堂，到底应该采取什么措施，是加以安抚还是把他按照叛逆加以征讨，这是一个问题。
对于这个问题，重臣们的意见也不一致，李春芳、陈以勤、马森等人认为应当对王兀堂加以招抚，因为王兀堂本来一向对大明恭顺，即便是到了现在，王兀堂也没有选择立即和觉昌安站到一起来，而是希望大明朝廷和朱载坖主持公道，他们认为，只要朝廷和朱载坖善加招抚，王兀堂至少会保持中立，不会倒向觉昌安，这样官军的胜算也高很多。
而高拱、杨博等人则认为，王兀堂反心已存，即便是现在不反，日后也必为大明祸患，而且宽甸乃是膏腴之地，王兀堂怎么可能就此罢休，一旦有机会，他肯定也会反叛的。杨博认为，由于六堡的建立，在军事上朝廷和王兀堂部实际已经是对立了。同时经济生活上，六堡所在地区本身就是董鄂部生存之地，六堡严重威胁了董鄂部的生计，王兀堂怎么可能善罢甘休，现在的忍气吞声，不过是韬光养晦罢了。
既然现在大明有能力剿灭他们，就应该一鼓作气，将这些祸患一举荡平，免得日后为祸。
对于他们两派的不同看法，朱载坖一事有些拿不定主意，于是朱载坖再次以严旨要求王兀堂明白回复大明，是否与官军一道剿除觉昌安，如果觉昌安被剿灭之后，可以将原来觉昌安的地盘分给王兀堂一部分，如若不然，一旦天兵到来，立成齑粉矣！