在朱载坖和重臣们商量有关文思院的事情时，东南的情况也在发生变化，随着水稻成熟，一年一度的征缴税粮的工作即将在东南展开，对于即将到来的赋税征收，无论是坐镇南京的督师大学士张居正还是总督浙直胡宗宪、南直隶巡抚杨继盛，甚至于苏州知府蔡国熙，都是极为重视的，生怕出什么乱子。
张居正为此事多次和胡宗宪、杨继盛、蔡国熙乃至于卢镗、刘显沟通此事，首先就是赋税的征收，若全征本色，朝廷并没有得到好处，若征折色银，百姓就会面对士绅和商贾的双重逼迫，这必然会激起民变。
这个赋税，到底应该怎么征收，张居正和东南的各级官员们最近一直在商议这事，之前的苏松官司风波，最终以朝廷出台政策给强力打压了，朝廷的法度当然是尽量保障百姓的权利不受损害，而地主在这些官司中或多或少的都损失了利益。
当然杨继盛和胡宗宪也抓捕甚至正法了一批以诉讼为业的刁民，采取强力手段将苏松的风波镇压下去了，但是士绅们当然不可能就此罢休。
据苏州知府蔡国熙汇报，今年苏州的地主们纷纷要求佃户向他们缴纳银两而非实物，而地主们的理由是朝廷要求缴纳折色，所以他们也要收折色租子，用来交给朝廷，实际上就是把锅推给朝廷，使得百姓怨恨朝廷，朝廷根本没有明确说只准缴纳折色银，这些士绅们是拿朝廷当挡箭牌用呢。
张居正在和胡宗宪等人商量这个折色的征收方式，徭役折色肯定是要征银的，但是田赋是否要折色，张居正和杨继盛、蔡国熙还是有很大的分歧的，对于张居正来说，他作为内阁辅臣，更多的是要考虑朝廷的用度问题，大量征收本色，运输不便，在运输过程中还极易损耗，朝廷也不便支用。
所以张居正的意思是尽量少征本色，多征折色，而且折色以银为主，便于朝廷使用。
而杨继盛和蔡国熙作为地方主官，当然首先担心的是地方的安定，他们认为征收折色过多，会导致苏松等处百姓怨恨朝廷，所以应当尽量少征折色，多征本色，而且也不应当仅仅折银，也可以折绢帛或者布匹这样百姓产出之物，尽可能的减少百姓的负担。
张居正认为本色征三分即可，七分折色，而蔡国熙等人认为，最好是本色折色五五开，为此事张居正和杨继盛、蔡国熙互不相让，甚至把官司打到了朱载坖的案头。
张居正、蔡国熙、杨继盛、胡宗宪等都各自上疏，要求朱载坖来决断本色折色征纳的比例问题。
朱载坖收到他们的奏疏之后，召集内阁辅臣和户部尚书马森，朱载坖问道：“诸位以为，东南的本折之争，应该怎么办啊？”
从朝廷的角度来说，折色显然是更加有利的，毕竟就算是运输一百万两银子，也不是什么难事，而且不会在运输途中有什么损耗，而要是运输一百万石的粮米，那可就要费老大的劲了，而且路上的损耗也是显而易见的，朝廷为此投入的成本肯定是远远大于折色的。
而且本色解运来之后，还有保管、储存等一系列问题，粮食储存总是要有一个期限的，陈粮不可食用，而且大量的本色米调拨也不方便，远远不如折色来的方便，所以朝廷重臣都支持张居正的主张，要多征折色以解决现在的朝廷财政问题。
但是朱载坖和高拱有不同的想法，高拱倾向于支持蔡国熙，原因很简单，大量征收折色对于百姓的负担太重，百姓手中并没有太多的现银，势必会损伤百姓的利益，而且朝廷也需要有一定量的储积来应对可能发生的各种突发情况。
现在京通仓的存粮是远远不足的，这些多征收的本色应当发运到通州储存起来，以备不时之需。
对于高拱的看法，朱载坖予以了支持，而且他已经派遣陈矩南下苏州，就是准备用内帑稳定苏州的粮价，以应对商贾和士绅们可能压迫百姓的举动。而且为了推广大明制钱，这次陈矩带着南下的银钱中，一半是银子，一半是铜钱，还是嘉靖年间用倭铜铸造的嘉靖通宝。
朱载坖在听取了诸位臣子们建议之后，亲自拍板，本色折色五五开，同时折色不限于白银，绢一匹准粮一石二斗，绵布一匹准一石，银三钱折粮一石，苏松地区出产的布匹丝绸都可以作为折色缴纳，尽可能的减少百姓的负担，同时朱载坖还和户部尚书马森商量好了，折色的布匹丝绸，朱载坖到时候用内承运库的银钱与太仓等价交换。
这样的话，太仓中仍然只储存白银和制钱，方便朝廷支用。
而布匹等物对于朱载坖来说是很实用的，因为朱载坖赏赐官员士卒，都需要使用大量的布匹丝绸，而且剩余的丝绸布匹还可以高价给王直贩运到倭国去，现在王直基本上已经垄断了大明和倭国的贸易，毕竟他背后站着的可是朱载坖。一些小的走私团伙根本不是他的对手，要么被吞并要么就被消灭。
得知大明终于开始开放海禁，王直当然是极为高兴的，主动向朱载坖献上白银十万两，黄金一万两，还有各种新式西洋军器和一艘西洋船只，朱载坖当然也是投桃报李，给王直的儿子锦衣千户的职务，这对于王直来说简直是梦寐以求的事情。相当于朱载坖终于承认了王直的身份，他以后就不再是走私商人了，而是正经的皇商了。
所以当朱载坖要求王直扩大对倭国的贸易，获取铜料以供应大明，同时向王直的船队中派遣锦衣校尉，负责侦察倭国的详细情况时，王直满口答应下来，保证明年会带来更多的白银和铜料，还有朱载坖要求的各种西洋军器、工匠。
看着王直从倭国运来的大量白银解送内承运库，朱载坖当然是十分开心的，还有大量的铜料，不仅可以铸钱，还有就是铸造火炮以供官军使用。